不同物種間的基因交流，是生物演化很關(guān)鍵的推動(dòng)力量，我個(gè)人認(rèn)為，其意義恐怕要大于自身基因組變異所帶來(lái)的影響。

首先舉一個(gè)大家都知道的例子，高中課本上的肺炎雙球菌實(shí)驗(yàn)
R型菌是怎么變成S型菌的？這就是一種基因的交流。

下面我們來(lái)說(shuō)真核生物。

對(duì)于人和病毒的恩恩怨怨，請(qǐng)看在人類(lèi)基因方面有趣的發(fā)現(xiàn)或研究。令人玩味很久的一點(diǎn)，真正的胎盤(pán)，極可能是病毒帶給人類(lèi)，以及所有后獸亞綱動(dòng)物的祖先的。這一次戰(zhàn)略合作發(fā)生在恐龍時(shí)代。形成胎盤(pán)所需的合胞體原本是病毒蛋白，最終為我們的祖先所“馴化”，成為自己的基因。哺乳動(dòng)物在新生代稱(chēng)霸地球，與此的關(guān)系恐怕是巨大的。

如果我們把眼光放到元古代（也可能是太古代，who knows……反正是好幾十億年前了），所有真核生物的祖先與一群營(yíng)有氧呼吸的立克次氏體發(fā)生了內(nèi)共生。DUANG的一聲，一個(gè)有線粒體的真核細(xì)胞誕生了。通過(guò)獲得線粒體，真核生物對(duì)能量的利用效率大幅提升，終于成為了生物演化的“溫拿”。日久天長(zhǎng)，很多與線粒體相關(guān)的基因，也慢慢轉(zhuǎn)移到了核基因組中。這恐怕是地球歷史上最成功，也最關(guān)鍵的一次基因交流了。

重要性?xún)H次于此的，同樣是一次內(nèi)共生事件。那個(gè)獲得了線粒體的第一個(gè)真核細(xì)胞，誕下了許多后代。其中有一個(gè)，與遍布原始海洋的藍(lán)細(xì)菌發(fā)生了內(nèi)共生，DUANG的一聲，第一個(gè)可以營(yíng)光合作用的真核細(xì)胞誕生了，那個(gè)藍(lán)細(xì)菌變成了原始的葉綠體。與線粒體一樣，許多與葉綠體相關(guān)的基因也轉(zhuǎn)移到核基因組中。

圖片來(lái)自wiki，更多內(nèi)容參閱：Endosymbiont

在此之后，內(nèi)共生還發(fā)生過(guò)很多次，帶來(lái)了很多新的可以進(jìn)行光合作用的物種。內(nèi)共生就好像夫妻倆結(jié)婚，而它們基因上的交流，就好比把許多婚前財(cái)產(chǎn)也列為了共同財(cái)產(chǎn)……如此，他們變成了一個(gè)更緊密的新個(gè)體。

而且，如果僅是通過(guò)基因組變異的方式，這種側(cè)面上的演化似乎是很難發(fā)生的。

時(shí)至今日，在微生物，以及簡(jiǎn)單的多細(xì)胞生物層面上，物種間的基因交流依然在頻繁地發(fā)生。那么，作為更復(fù)雜的生物，比如人類(lèi)，是否也擁有一些來(lái)自遠(yuǎn)緣物種的基因呢？答案似乎是肯定的。

今年（2015年）年初，一篇發(fā)表在Genome Biology上的文章聲稱(chēng)，基因從低等生物向高等生物轉(zhuǎn)移，甚至向人類(lèi)轉(zhuǎn)移，應(yīng)該是可能的。
——Crisp等比較了來(lái)自40種動(dòng)物的基因組序列，包括果蠅和蛔蟲(chóng)到斑馬魚(yú)、大猩猩和人類(lèi)。對(duì)基因組中每個(gè)基因，研究人員都搜索了已有數(shù)據(jù)庫(kù)，以便在動(dòng)物之間以及非動(dòng)物之間找出最近的匹配基因，其范圍包括植物、真菌、細(xì)菌和病毒。當(dāng)一種動(dòng)物基因更密切匹配一種非動(dòng)物基因，而與其他任何動(dòng)物基因不匹配時(shí)，便進(jìn)行更深入研究，利用計(jì)算方法確定初始數(shù)據(jù)庫(kù)搜索是否曾發(fā)生錯(cuò)誤匹配。研究人員最終確定了數(shù)百種似乎從細(xì)菌、古生菌、真菌、其他微生物和植物轉(zhuǎn)移給動(dòng)物的基因。對(duì)人類(lèi)而言，研究人員發(fā)現(xiàn)有145種看起來(lái)源自更簡(jiǎn)單生物體，包括17例過(guò)去曾報(bào)道的水平基因轉(zhuǎn)移現(xiàn)象。Crisp說(shuō)，這一發(fā)現(xiàn)表明，基因水平轉(zhuǎn)移不僅局限于微生物之間，同時(shí)也在許多動(dòng)物，甚至可能是所有動(dòng)物進(jìn)化中起到了重要作用?！侣劯逶恼?qǐng)參見(jiàn)Humans may harbor more than 100 genes from other organisms
目前這篇發(fā)在IF10的刊物上的文章，9個(gè)月已經(jīng)被引了20多次了，雖然支持與反對(duì)并存，不過(guò)我倒傾向于認(rèn)為它是真的。